MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus infernus ME chromosome

Total Repeats: 32544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014122	AAT	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108689
2	NC_014122	CAT	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108689
3	NC_014122	T	6	6	171	176	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
4	NC_014122	CTT	2	6	194	199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108689
5	NC_014122	T	7	7	198	204	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
6	NC_014122	TAT	2	6	240	245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108689
7	NC_014122	CATA	2	8	248	255	50 %	25 %	0 %	25 %	296108689
8	NC_014122	T	7	7	260	266	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
9	NC_014122	ACT	2	6	328	333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108689
10	NC_014122	AAT	2	6	444	449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108689
11	NC_014122	T	6	6	461	466	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
12	NC_014122	CTT	2	6	611	616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108689
13	NC_014122	T	7	7	615	621	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
14	NC_014122	TAA	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108689
15	NC_014122	TTTA	2	8	645	652	25 %	75 %	0 %	0 %	296108689
16	NC_014122	T	7	7	672	678	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
17	NC_014122	TGA	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108689
18	NC_014122	TTAT	2	8	805	812	25 %	75 %	0 %	0 %	296108689
19	NC_014122	T	7	7	814	820	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
20	NC_014122	ATG	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108689
21	NC_014122	A	6	6	834	839	100 %	0 %	0 %	0 %	296108689
22	NC_014122	T	6	6	860	865	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
23	NC_014122	T	6	6	902	907	0 %	100 %	0 %	0 %	296108689
24	NC_014122	TA	3	6	918	923	50 %	50 %	0 %	0 %	296108689
25	NC_014122	AGG	2	6	960	965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108689
26	NC_014122	TATC	2	8	983	990	25 %	50 %	0 %	25 %	296108689
27	NC_014122	TTA	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108689
28	NC_014122	TGC	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108689
29	NC_014122	ATG	2	6	1041	1046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108689
30	NC_014122	TAA	2	6	1050	1055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108689
31	NC_014122	TCA	2	6	1117	1122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108690
32	NC_014122	GCT	2	6	1135	1140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108690
33	NC_014122	ATTA	2	8	1145	1152	50 %	50 %	0 %	0 %	296108690
34	NC_014122	CAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108690
35	NC_014122	T	6	6	1238	1243	0 %	100 %	0 %	0 %	296108690
36	NC_014122	AT	3	6	1259	1264	50 %	50 %	0 %	0 %	296108690
37	NC_014122	TAAA	2	8	1300	1307	75 %	25 %	0 %	0 %	296108690
38	NC_014122	TC	3	6	1353	1358	0 %	50 %	0 %	50 %	296108690
39	NC_014122	T	6	6	1386	1391	0 %	100 %	0 %	0 %	296108690
40	NC_014122	CTCAT	2	10	1434	1443	20 %	40 %	0 %	40 %	296108690
41	NC_014122	T	6	6	1470	1475	0 %	100 %	0 %	0 %	296108690
42	NC_014122	AAACA	2	10	1490	1499	80 %	0 %	0 %	20 %	296108690
43	NC_014122	ATG	2	6	1512	1517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108690
44	NC_014122	T	6	6	1538	1543	0 %	100 %	0 %	0 %	296108690
45	NC_014122	TAA	2	6	1564	1569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108690
46	NC_014122	CAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108690
47	NC_014122	AT	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	296108690
48	NC_014122	TAAA	2	8	1675	1682	75 %	25 %	0 %	0 %	296108690
49	NC_014122	TCC	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108690
50	NC_014122	T	6	6	1828	1833	0 %	100 %	0 %	0 %	296108690
51	NC_014122	T	6	6	1844	1849	0 %	100 %	0 %	0 %	296108690
52	NC_014122	AC	3	6	1872	1877	50 %	0 %	0 %	50 %	296108690
53	NC_014122	TAA	2	6	1902	1907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108690
54	NC_014122	CTT	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108690
55	NC_014122	AGGA	2	8	1933	1940	50 %	0 %	50 %	0 %	296108690
56	NC_014122	ATT	2	6	2024	2029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108690
57	NC_014122	TAAT	2	8	2094	2101	50 %	50 %	0 %	0 %	296108690
58	NC_014122	TTC	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108690
59	NC_014122	AGA	2	6	2153	2158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108690
60	NC_014122	TAA	2	6	2159	2164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108690
61	NC_014122	T	6	6	2165	2170	0 %	100 %	0 %	0 %	296108690
62	NC_014122	CCA	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108690
63	NC_014122	T	7	7	3326	3332	0 %	100 %	0 %	0 %	296108691
64	NC_014122	TTC	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108691
65	NC_014122	CTC	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108691
66	NC_014122	GCA	2	6	3440	3445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108691
67	NC_014122	ATA	2	6	3449	3454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108691
68	NC_014122	AGGTT	2	10	3465	3474	20 %	40 %	40 %	0 %	296108691
69	NC_014122	TTC	2	6	3520	3525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108691
70	NC_014122	CATC	2	8	3534	3541	25 %	25 %	0 %	50 %	296108691
71	NC_014122	TGT	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108691
72	NC_014122	TTA	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108691
73	NC_014122	AGA	2	6	3736	3741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108691
74	NC_014122	GAT	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108691
75	NC_014122	TCT	2	6	3818	3823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108691
76	NC_014122	TC	3	6	3854	3859	0 %	50 %	0 %	50 %	296108691
77	NC_014122	CTT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108691
78	NC_014122	CAG	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108691
79	NC_014122	T	7	7	3988	3994	0 %	100 %	0 %	0 %	296108691
80	NC_014122	TCA	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108692
81	NC_014122	CTT	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108692
82	NC_014122	TC	3	6	4078	4083	0 %	50 %	0 %	50 %	296108692
83	NC_014122	AAG	2	6	4110	4115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108692
84	NC_014122	CTG	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108692
85	NC_014122	TGT	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108692
86	NC_014122	AAC	2	6	4160	4165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108692
87	NC_014122	CTC	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108692
88	NC_014122	CTG	3	9	4304	4312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108692
89	NC_014122	AG	3	6	4319	4324	50 %	0 %	50 %	0 %	296108692
90	NC_014122	TTA	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108692
91	NC_014122	AG	3	6	4366	4371	50 %	0 %	50 %	0 %	296108692
92	NC_014122	T	7	7	4376	4382	0 %	100 %	0 %	0 %	296108692
93	NC_014122	CAA	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108692
94	NC_014122	TCA	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108692
95	NC_014122	ATTTT	2	10	4671	4680	20 %	80 %	0 %	0 %	296108692
96	NC_014122	TA	3	6	4681	4686	50 %	50 %	0 %	0 %	296108692
97	NC_014122	TTATA	2	10	4696	4705	40 %	60 %	0 %	0 %	296108692
98	NC_014122	T	6	6	4740	4745	0 %	100 %	0 %	0 %	296108692
99	NC_014122	T	6	6	4777	4782	0 %	100 %	0 %	0 %	296108693
100	NC_014122	TCT	2	6	4794	4799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108693
101	NC_014122	AG	3	6	4829	4834	50 %	0 %	50 %	0 %	296108693
102	NC_014122	GAT	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108693
103	NC_014122	AGC	2	6	4856	4861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108693
104	NC_014122	C	6	6	4861	4866	0 %	0 %	0 %	100 %	296108693
105	NC_014122	AATTA	2	10	4901	4910	60 %	40 %	0 %	0 %	296108693
106	NC_014122	GA	3	6	4952	4957	50 %	0 %	50 %	0 %	296108693
107	NC_014122	C	6	6	4973	4978	0 %	0 %	0 %	100 %	296108693
108	NC_014122	TC	3	6	5002	5007	0 %	50 %	0 %	50 %	296108693
109	NC_014122	CTT	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108693
110	NC_014122	AAC	2	6	5237	5242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108693
111	NC_014122	CTA	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108693
112	NC_014122	ACC	2	6	5438	5443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296108693
113	NC_014122	A	6	6	5463	5468	100 %	0 %	0 %	0 %	296108693
114	NC_014122	A	6	6	5515	5520	100 %	0 %	0 %	0 %	296108693
115	NC_014122	AAG	2	6	5547	5552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296108693
116	NC_014122	A	6	6	5556	5561	100 %	0 %	0 %	0 %	296108693
117	NC_014122	ACA	2	6	5565	5570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108693
118	NC_014122	A	7	7	5574	5580	100 %	0 %	0 %	0 %	296108693
119	NC_014122	TAATC	2	10	5594	5603	40 %	40 %	0 %	20 %	296108693
120	NC_014122	CT	3	6	5622	5627	0 %	50 %	0 %	50 %	296108694
121	NC_014122	AAAT	2	8	5641	5648	75 %	25 %	0 %	0 %	296108694
122	NC_014122	AAC	2	6	5785	5790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108694
123	NC_014122	GTTAA	2	10	5797	5806	40 %	40 %	20 %	0 %	296108694
124	NC_014122	TC	3	6	5840	5845	0 %	50 %	0 %	50 %	296108694
125	NC_014122	ATA	2	6	5881	5886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108694
126	NC_014122	TTG	2	6	5930	5935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108694
127	NC_014122	CTA	2	6	5945	5950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108694
128	NC_014122	CT	3	6	5955	5960	0 %	50 %	0 %	50 %	296108694
129	NC_014122	GCT	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108694
130	NC_014122	ATT	2	6	6022	6027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108694
131	NC_014122	CAG	2	6	6041	6046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108694
132	NC_014122	TA	3	6	6063	6068	50 %	50 %	0 %	0 %	296108694
133	NC_014122	AGG	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296108694
134	NC_014122	GAAT	2	8	6089	6096	50 %	25 %	25 %	0 %	296108694
135	NC_014122	ATAA	2	8	6171	6178	75 %	25 %	0 %	0 %	296108694
136	NC_014122	GAT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296108694
137	NC_014122	CTT	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108694
138	NC_014122	TAGA	2	8	6272	6279	50 %	25 %	25 %	0 %	296108694
139	NC_014122	CTG	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296108694
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273	NC_014122	CTC	2	6	11904	11909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108702
274	NC_014122	TCCT	2	8	11955	11962	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
275	NC_014122	TAA	2	6	11988	11993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108702
276	NC_014122	TCA	2	6	11998	12003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108702
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278	NC_014122	CCT	2	6	12020	12025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296108702
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280	NC_014122	ATC	3	9	12063	12071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296108702
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282	NC_014122	CT	3	6	12107	12112	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
283	NC_014122	CA	3	6	12113	12118	50 %	0 %	0 %	50 %	296108702
284	NC_014122	AGC	2	6	12123	12128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296108702
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289	NC_014122	CAA	2	6	12401	12406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296108702
290	NC_014122	TA	4	8	12464	12471	50 %	50 %	0 %	0 %	296108702
291	NC_014122	AT	3	6	12479	12484	50 %	50 %	0 %	0 %	296108702
292	NC_014122	C	6	6	12491	12496	0 %	0 %	0 %	100 %	296108702
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294	NC_014122	CTT	2	6	12519	12524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108702
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296	NC_014122	CT	5	10	12552	12561	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
297	NC_014122	TTTCCC	2	12	12568	12579	0 %	50 %	0 %	50 %	296108702
298	NC_014122	AAT	2	6	12588	12593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108702
299	NC_014122	AAT	2	6	12618	12623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296108703
300	NC_014122	TTC	2	6	12657	12662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108703
301	NC_014122	CTT	2	6	12785	12790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108703
302	NC_014122	CT	3	6	12796	12801	0 %	50 %	0 %	50 %	296108703
303	NC_014122	TC	3	6	12836	12841	0 %	50 %	0 %	50 %	296108703
304	NC_014122	T	6	6	12885	12890	0 %	100 %	0 %	0 %	296108703
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306	NC_014122	CTT	2	6	13014	13019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108703
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400	NC_014122	CTT	2	6	16832	16837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296108708
401	NC_014122	GTT	2	6	16881	16886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296108708
402	NC_014122	TAT	2	6	16950	16955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296108708
403	NC_014122	A	6	6	16965	16970	100 %	0 %	0 %	0 %	296108708
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